國(guó)科發(fā)火【2008】172號(hào)規(guī)定，科技部、財(cái)政部、稅務(wù)總局組成全國(guó)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作領(lǐng)導(dǎo)小組（以下稱(chēng)“領(lǐng)導(dǎo)小組”）, 領(lǐng)導(dǎo)小組下設(shè)辦公室。各省、自治區(qū)、直轄市、計(jì)劃單列市科技行政管理部門(mén)同本級(jí)財(cái)政、稅務(wù)部門(mén)組成本地區(qū)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理機(jī)構(gòu)（以下稱(chēng)“認(rèn)定機(jī)構(gòu)”）。高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的程序如下：

（一）企業(yè)自我評(píng)價(jià)及申請(qǐng)

企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”，對(duì)照本辦法第十條規(guī)定條件，進(jìn)行自我評(píng)價(jià)。認(rèn)為符合認(rèn)定條件的，企業(yè)可向認(rèn)定機(jī)構(gòu)提出認(rèn)定申請(qǐng)。

（二）提交下列申請(qǐng)材料

1. 高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請(qǐng)書(shū)；

2. 企業(yè)營(yíng)業(yè)執(zhí)照副本、稅務(wù)登記證（復(fù)印件）；

3. 知識(shí)產(chǎn)權(quán)證書(shū)（獨(dú)占許可合同）、生產(chǎn)批文，新產(chǎn)品或新技術(shù)證明（查新）材料、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)報(bào)告、省級(jí)以上科技計(jì)劃立項(xiàng)證明，以及其他相關(guān)證明材料；

4. 企業(yè)職工人數(shù)、學(xué)歷結(jié)構(gòu)以及研發(fā)人員占企業(yè)職工的比例說(shuō)明；

5. 經(jīng)具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用情況表（實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限），并附研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)說(shuō)明材料；

6. 經(jīng)具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)報(bào)表（含資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、現(xiàn)金流量表，實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）以及技術(shù)性收入的情況表。

（三）合規(guī)性審查

認(rèn)定機(jī)構(gòu)應(yīng)建立高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定評(píng)審專(zhuān)家?guī)欤灰罁?jù)企業(yè)的申請(qǐng)材料，抽取專(zhuān)家?guī)靸?nèi)專(zhuān)家對(duì)申報(bào)企業(yè)進(jìn)行審查，提出認(rèn)定意見(jiàn)。

（四）認(rèn)定、公示與備案

認(rèn)定機(jī)構(gòu)對(duì)企業(yè)進(jìn)行認(rèn)定。經(jīng)認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公示15個(gè)工作日，沒(méi)有異議的，報(bào)送領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案，在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公告認(rèn)定結(jié)果，并向企業(yè)頒發(fā)統(tǒng)一印制的“高新技術(shù)企業(yè)證書(shū)”。