誤區(qū)一：將高新認(rèn)定研發(fā)費用作加計扣除基數(shù)

　　在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定時，企業(yè)往往會委托稅務(wù)師事務(wù)所對企業(yè)近3個會計年度的研究開發(fā)費用（實際年限不足3年的按實際經(jīng)營年限計算）以及近1個會計年度的高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入出具專項鑒證報告。在年度匯算清繳時，不少企業(yè)認(rèn)為高新認(rèn)定的研究開發(fā)費用是經(jīng)稅務(wù)師事務(wù)所鑒證認(rèn)定的，可以直接將鑒定報告中對應(yīng)年度的研究開發(fā)費用作為基數(shù)，享受加計扣除的稅收優(yōu)惠。

　　其實，在企業(yè)研究開發(fā)費用歸集上，高新認(rèn)定時是依據(jù)科技部、財政部、國家稅務(wù)總局發(fā)布的《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》（國科發(fā)火[2008]362號，以下簡稱《指引》）進行的，而確定企業(yè)可以享受加計扣除優(yōu)惠，依據(jù)的是國家稅務(wù)總局《企業(yè)研究開發(fā)費用稅前扣除管理辦法（試行）》（國稅發(fā)[2008]116號，以下簡稱《辦法》），兩者的適用情況并不一樣，不能混為一談?！掇k法》規(guī)定的可加計扣除的研究開發(fā)費用，其口徑要小于按照《指引》要求歸集的研究開發(fā)費用。因此，高新技術(shù)企業(yè)進行研究開發(fā)費用加計扣除必須謹(jǐn)慎，一定要嚴(yán)格按照《辦法》的規(guī)定進行研究開發(fā)費加計扣除，否則會存在較大的稅務(wù)風(fēng)險。

　　誤區(qū)二：老高新技術(shù)企業(yè)未重新認(rèn)證就享受優(yōu)惠

　　2008年，仍有不少老高新技術(shù)企業(yè)未能及時學(xué)習(xí)有關(guān)高新技術(shù)企業(yè)的最新稅收政策規(guī)定，在年度匯算清繳時，仍按15%的稅率進行了納稅申報。也有不少納稅人認(rèn)為能夠享受過渡期稅收優(yōu)惠。

　　實際上，按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于實施高新技術(shù)企業(yè)所得稅優(yōu)惠有關(guān)問題的通知》（國稅函[2009]203號）的規(guī)定，原依法享受企業(yè)所得稅定期減免稅優(yōu)惠尚未期滿的高新技術(shù)企業(yè)，按照新標(biāo)準(zhǔn)取得高新技術(shù)企業(yè)資格證書之后，可以在2008年1月1日后在未到期的時間段內(nèi)享受過渡期優(yōu)惠政策。

　　因此，老高新技術(shù)企業(yè)要想享受15%的優(yōu)惠稅率，或享受過渡期優(yōu)惠政策，必須按高新技術(shù)企業(yè)的心要求進行重新申請認(rèn)定，并向主管稅務(wù)機關(guān)備案，而不能直接自行享受稅收優(yōu)惠。

　　誤區(qū)三：不能疊加享受優(yōu)惠政策

　　不少高新技術(shù)企業(yè)根據(jù)《國務(wù)院關(guān)于實施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策的通知》（國發(fā)[2007]39號）和《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于執(zhí)行企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策若干問題的通知》（財稅[2009]69號）的規(guī)定，認(rèn)為高新技術(shù)企業(yè)優(yōu)惠政策不得疊加享受。享受高新技術(shù)企業(yè)15%的優(yōu)惠稅率后，不管什么情況，都不得享受其他定期減免稅和減低稅率類的稅收優(yōu)惠。

　　其實，這是對上述兩個文件的誤讀。兩個文件規(guī)定企業(yè)享受優(yōu)惠政策時“不得疊加享受，且一經(jīng)選擇，不得改變”的規(guī)定，是限于企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策與《企業(yè)所得稅法》及其實施條例中規(guī)定的定期減免稅和減低稅率類的稅收優(yōu)惠。而《企業(yè)所得稅法》及其實施條例中規(guī)定的其他各項稅收優(yōu)惠，凡企業(yè)符合規(guī)定條件的，可以同時享受。

　　例如，2007年底前設(shè)立的軟件生產(chǎn)企業(yè)和集成電路生產(chǎn)企業(yè)，經(jīng)認(rèn)定取得高新技術(shù)企業(yè)資格后，就可以享受高新技術(shù)企業(yè)的稅收優(yōu)惠。同時按照《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財稅[2008]1號）的規(guī)定，還可以享受企業(yè)所得稅定期減免稅優(yōu)惠政策。該文件明確，根據(jù)新《企業(yè)所得稅法》的規(guī)定，我國境內(nèi)新辦軟件生產(chǎn)企業(yè)經(jīng)認(rèn)定后，自獲利年度起，第一年和第二年免征企業(yè)所得稅，第三年至第五年減半征收企業(yè)所得稅。這種情況下，軟件生產(chǎn)企業(yè)“兩免三減半”的優(yōu)惠也應(yīng)該是新《企業(yè)所得稅法》下的優(yōu)惠。

　　69號文件第二條第二款規(guī)定：“企業(yè)所得稅法及其實施條例中規(guī)定的各項稅收優(yōu)惠，凡企業(yè)符合規(guī)定條件的，可以同時享受”。也就是說，上述軟件生產(chǎn)企業(yè)和集成電路生產(chǎn)企業(yè)，可以同時享受高新技術(shù)企業(yè)稅收優(yōu)惠和企業(yè)所得稅“兩免三減半”的優(yōu)惠。

　　誤區(qū)四：各項補貼不區(qū)分收入性質(zhì)

　　由于高新技術(shù)企業(yè)受到國家有關(guān)部門和各級政府的大力支持，各種名目的補貼往往比較多。例如，各種稅收返還、財政獎勵、技術(shù)創(chuàng)新獎勵、專項研發(fā)項目補助等。但很多企業(yè)匯算清算時往往不區(qū)分各項補貼的收入性質(zhì)，誤把應(yīng)稅收入認(rèn)為是不征稅收入或免稅收入，把不征稅收認(rèn)為是免稅收入。

　　不征稅收入是我國新《企業(yè)所得稅法》中新創(chuàng)設(shè)的一個概念，是指從企業(yè)所得稅原理上講應(yīng)永久不列入征稅收入的范疇。根據(jù)規(guī)定，不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應(yīng)納稅所得額時扣除；用于支出所形成的資產(chǎn)，其計算的折舊、攤銷不得在計算應(yīng)納稅所得額時扣除。

　　免稅收入是一種稅式支出，其本身已構(gòu)成應(yīng)稅收入，但基于稅收優(yōu)惠政策而予以免除。它是國家根據(jù)經(jīng)濟政策目標(biāo)的需要，在一定時間內(nèi)免予征稅，而在一定時期又可能恢復(fù)征稅的收入，其支出允許稅前列支。根據(jù)新《企業(yè)所得稅法》第二十六條規(guī)定，免稅收入分為以下四類：國債利息收入，符合條件的居民企業(yè)之間的股息、紅利等權(quán)益性投資收益，在中國境內(nèi)設(shè)立機構(gòu)、場所的非居民企業(yè)從居民企業(yè)取得與該機構(gòu)、場所有實際聯(lián)系的股息、紅利等權(quán)益性投資收益，符合條件的非營利組織的收入等。

　　因此，各項補貼收入性質(zhì)認(rèn)定是否正確，影響著應(yīng)稅收入、稅前扣除項目、應(yīng)納稅所得等的計算，最終影響應(yīng)納稅額的正確與否，值得高新技術(shù)企業(yè)高度關(guān)注。此外，與研究開發(fā)活動相關(guān)的補貼，享受加計扣除時也要剔除，這也值得關(guān)注。