“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財政調(diào)庫”是《辦法》的核心內(nèi)容。統(tǒng)一計算，是指企業(yè)總機構(gòu)統(tǒng)一計算包括企業(yè)所屬各個不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)、場所在內(nèi)的全部應(yīng)納稅所得額、應(yīng)納稅額；分級管理，是指總機構(gòu)、分支機構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機關(guān)都有對當(dāng)?shù)貦C構(gòu)進行企業(yè)所得稅管理的責(zé)任，總機構(gòu)和分支機構(gòu)應(yīng)分別接受機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)的管理；就地預(yù)繳，是指總機構(gòu)、分支機構(gòu)應(yīng)按本辦法的規(guī)定，分月或分季分別向所在地主管稅務(wù)機關(guān)申報預(yù)繳企業(yè)所得稅；匯總清算，是指在年度終了后，總機構(gòu)負責(zé)進行企業(yè)所得稅的年度匯算清繳，統(tǒng)一計算企業(yè)的年度應(yīng)納所得稅額，抵減總機構(gòu)、分支機構(gòu)當(dāng)年已就地分期預(yù)繳的企業(yè)所得稅款后，多退少補稅款；財政調(diào)庫，是指財政部定期將繳入中央國庫的跨地區(qū)總分機構(gòu)企業(yè)所得稅待分配收入，按照核定的系數(shù)調(diào)整至地方金庫。

　　《辦法》明確了匯總納稅的范圍。居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市）設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)、場所的，該居民企業(yè)即為匯總納稅企業(yè)，除另有規(guī)定外，適用本辦法。鐵路運輸企業(yè)（包括廣鐵集團和大秦鐵路公司）、國有郵政企業(yè)、中國工商銀行股份有限公司、中國農(nóng)業(yè)銀行、中國銀行股份有限公司、國家開發(fā)銀行、中國農(nóng)業(yè)發(fā)展銀行、中國進出口銀行、中央?yún)R金投資有限責(zé)任公司、中國建設(shè)銀行股份有限公司、中國建銀投資有限責(zé)任公司、中國石油天然氣股份有限公司、中國石油化工股份有限公司以及海洋石油天然氣企業(yè)（包括港澳臺和外商投資、外國海上石油天然氣企業(yè)）等繳納所得稅未納入中央和地方分享范圍的企業(yè)，不適用本辦法。

　　稅款預(yù)繳和匯算清繳是匯總納稅企業(yè)繳納企業(yè)所得稅的關(guān)鍵環(huán)節(jié)?！掇k法》規(guī)定，企業(yè)應(yīng)根據(jù)當(dāng)期實際利潤額，按照本辦法規(guī)定的預(yù)繳分攤方法計算總機構(gòu)和分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅預(yù)繳額，分別由總機構(gòu)和分支機構(gòu)分月或者分季就地預(yù)繳。在規(guī)定期限內(nèi)按實際利潤額預(yù)繳有困難的，經(jīng)總機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)認可，可以按照上一年度應(yīng)納稅所得額的1/12或1/4，由總機構(gòu)、分支機構(gòu)就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。預(yù)繳方式一經(jīng)確定，當(dāng)年度不得變更。

　　總機構(gòu)和分支機構(gòu)應(yīng)分期預(yù)繳的企業(yè)所得稅，50%在各分支機構(gòu)間分攤預(yù)繳，50%由總機構(gòu)預(yù)繳?？倷C構(gòu)預(yù)繳的部分，其中25%就地入庫，25%預(yù)繳入中央國庫?？偡謾C構(gòu)均應(yīng)在每月或季度終了之日起15日內(nèi)，就其分攤的所得稅額向所在地主管稅務(wù)機關(guān)申報預(yù)繳。

　　總機構(gòu)應(yīng)按照以前年度（1月～6月按上上年度，7月～12月按上年度）各分支機構(gòu)的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額三個因素計算各分支機構(gòu)應(yīng)分攤所得稅款的比例，三個因素的權(quán)重依次為0.35、0.35、0.30.

　　《辦法》規(guī)定，總機構(gòu)和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級分支機構(gòu)，就地分期預(yù)繳企業(yè)所得稅。二級分支機構(gòu)及其下屬機構(gòu)均由二級分支機構(gòu)集中就地預(yù)繳企業(yè)所得稅；三級及以下分支機構(gòu)不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額統(tǒng)一計入二級分支機構(gòu)。不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當(dāng)?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務(wù)、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級及以下分支機構(gòu)，不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。

　　上年度認定為小型微利企業(yè)的，其分支機構(gòu)不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅；新設(shè)立的分支機構(gòu)，設(shè)立當(dāng)年不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅；撤銷的分支機構(gòu)，撤銷當(dāng)年剩余期限內(nèi)應(yīng)分攤的企業(yè)所得稅款由總機構(gòu)繳入中央國庫；企業(yè)在中國境外設(shè)立的不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)，不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。

　　《辦法》規(guī)定，總機構(gòu)在年度終了后5個月內(nèi)，應(yīng)依照法律、法規(guī)和其他有關(guān)規(guī)定進行匯總納稅企業(yè)的所得稅年度匯算清繳。各分支機構(gòu)不進行企業(yè)所得稅匯算清繳。當(dāng)年應(yīng)補繳的所得稅款，由總機構(gòu)繳入中央國庫。當(dāng)年多繳的所得稅款，由總機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)開具“稅收收入退還書”等憑證，按規(guī)定程序從中央國庫辦理退庫。

　　為了加強對匯總納稅企業(yè)繳納企業(yè)所得稅的管理，《辦法》還規(guī)定了總機構(gòu)應(yīng)報送《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構(gòu)分配表》、將其所有二級分支機構(gòu)報主管稅務(wù)機關(guān)備案等管理措施。

　　國家稅務(wù)總局強調(diào)，實行法人所得稅制度是新《企業(yè)所得稅法》的重要內(nèi)容，《辦法》是有效解決法人所得稅制度下稅源跨省市轉(zhuǎn)移問題的具體征管辦法。各地務(wù)必統(tǒng)一思想，增強大局意識，認真學(xué)習(xí)領(lǐng)會，深入貫徹執(zhí)行。各級、各地稅務(wù)機關(guān)要加強合作、密切配合，切實做好基礎(chǔ)工作，確保新辦法的平穩(wěn)運行。