一、《公告》出臺的背景
　　《財政部 稅務(wù)總局 海關(guān)總署關(guān)于深化增值稅改革有關(guān)政策的公告》（財政部 稅務(wù)總局 海關(guān)總署公告2019年第39號，以下稱39號公告）出臺后，為方便納稅人辦理留抵退稅業(yè)務(wù)，稅務(wù)總局制發(fā)了《國家稅務(wù)總局關(guān)于辦理增值稅期末留抵稅額退稅有關(guān)事項的公告》（以下稱《公告》），就留抵退稅政策實施過程中涉及的相關(guān)征管事項進一步予以明確。
　　二、符合什么條件的納稅人可以向主管稅務(wù)機關(guān)申請留抵退稅？
　　同時符合以下條件的納稅人，可以向主管稅務(wù)機關(guān)申請退還增量留抵稅額：
　　（一）自2019年4月稅款所屬期起，連續(xù)六個月（按季納稅的，連續(xù)兩個季度）增量留抵稅額均大于零，且第六個月增量留抵稅額不低于50萬元；
　?。ǘ┘{稅信用等級為A級或者B級；
　?。ㄈ┥暾埻硕惽?6個月未發(fā)生騙取留抵退稅、出口退稅或虛開增值稅專用發(fā)票情形的；
　?。ㄋ模┥暾埻硕惽?6個月未因偷稅被稅務(wù)機關(guān)處罰兩次及以上的；
　　（五）自2019年4月1日起未享受即征即退、先征后返（退）政策的。
　　增量留抵稅額，是指與2019年3月底相比新增加的期末留抵稅額。
　　三、允許退還的增量留抵稅額如何計算？
　　納稅人當期允許退還的增量留抵稅額，按照以下公式計算：
　　允許退還的增量留抵稅額=增量留抵稅額×進項構(gòu)成比例×60%
　　進項構(gòu)成比例，為2019年4月至申請退稅前一稅款所屬期內(nèi)已抵扣的增值稅專用發(fā)票（含稅控機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票）、海關(guān)進口增值稅專用繳款書、解繳稅款完稅憑證注明的增值稅額占同期全部已抵扣進項稅額的比重。
　　四、納稅人如何向稅務(wù)機關(guān)申請辦理留抵退稅？
　　《公告》明確，納稅人申請辦理留抵退稅，應在符合條件的次月起，在申報期內(nèi)完成本期申報后，通過電子稅務(wù)局或辦稅服務(wù)廳提交《退（抵）稅申請表》，并對如何填寫該表進行了詳細說明。
　　此外，《公告》明確了留抵退稅申請和出口退稅申報的銜接問題，即納稅人適用免抵退稅辦法的，可以在同一申報期內(nèi)，既申報免抵退稅又申請留抵退稅；當期可申報免抵退稅的出口銷售額為零的，應辦理免抵退稅零申報。
　　五、稅務(wù)機關(guān)是否需要對納稅人進行審核確認？如何審核？
　　在辦理留抵退稅過程中，稅務(wù)機關(guān)對納稅人是否符合留抵退稅條件、當期可退還增量留抵稅額等進行審核確認，并區(qū)分不同情形進行處理： 
　　1.準予辦理留抵退稅。對于符合退稅條件，且不存在公告所列情形的，稅務(wù)機關(guān)應在一定期限內(nèi)完成審核，并向納稅人出具準予留抵退稅的《稅務(wù)事項通知書》。
　　2.暫停（終止）辦理留抵退稅。對于符合退稅條件，但納稅人存在增值稅涉稅風險疑點，或存在未處理的相關(guān)涉稅事項等情形的，明確先暫停為其辦理留抵退稅。
　　（1）如果風險疑點排除且相關(guān)事項處理完畢，仍符合留抵退稅條件的，稅務(wù)機關(guān)繼續(xù)為其辦理留抵退稅；
　　（2）如果風險疑點排除且相關(guān)事項處理完畢后，不再符合留抵退稅條件的，稅務(wù)機關(guān)不予辦理留抵退稅；
　?。?）如果在進行風險排查時，發(fā)現(xiàn)納稅人涉嫌增值稅重大稅收違法的，終止為其辦理留抵退稅。在稅務(wù)機關(guān)對納稅人涉嫌增值稅重大稅收違法問題核實處理完畢后，納稅人仍符合留抵退稅條件的，可重新申請辦理留抵退稅。
　　3．不予辦理留抵退稅。經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審核，對不符合留抵退稅條件的納稅人，不予辦理留抵退稅，并向納稅人出具不予留抵退稅的《稅務(wù)事項通知書》。
　　六、在稅務(wù)機關(guān)準予留抵退稅后，納稅人應如何進行相關(guān)稅務(wù)處理？
　　《公告》明確，納稅人應在收到稅務(wù)機關(guān)準予留抵退稅的《稅務(wù)事項通知書》當期，按照稅務(wù)機關(guān)核準的允許退還的增量留抵稅額，沖減期末留抵稅額，并在辦理增值稅納稅申報時，相應填寫《增值稅納稅申報表附列資料（二）（本期進項稅額明細）》第22欄“上期留抵稅額退稅”。
　　七、如果發(fā)現(xiàn)納稅人騙取留抵退稅，如何追責？
　　納稅人以虛增進項、虛假申報或其他欺騙手段，騙取留抵退稅的，由稅務(wù)機關(guān)追繳其騙取的退稅款，并按照《中華人民共和國稅收征收管理法》等有關(guān)規(guī)定處理。

　　相關(guān)閱讀：國家稅務(wù)總局關(guān)于辦理增值稅期末留抵稅額退稅有關(guān)事項的公告  國家稅務(wù)總局公告2019年第20號