一、關(guān)于二級(jí)分支機(jī)構(gòu)的判定問(wèn)題

    二級(jí)分支機(jī)構(gòu)是指總機(jī)構(gòu)對(duì)其財(cái)務(wù)、業(yè)務(wù)、人員等直接進(jìn)行統(tǒng)一核算和管理的領(lǐng)取非法人營(yíng)業(yè)執(zhí)照的分支機(jī)構(gòu)。

    總機(jī)構(gòu)應(yīng)及時(shí)將其所屬二級(jí)分支機(jī)構(gòu)名單報(bào)送總機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)，并向其所屬二級(jí)分支機(jī)構(gòu)及時(shí)出具有效證明（支持證明的材料包括總機(jī)構(gòu)撥款證明、總分機(jī)構(gòu)協(xié)議或合同、公司章程、管理制度等）。

    二級(jí)分支機(jī)構(gòu)在辦理稅務(wù)登記時(shí)應(yīng)向其所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送非法人營(yíng)業(yè)執(zhí)照（復(fù)印件）和由總機(jī)構(gòu)出具的二級(jí)分支機(jī)構(gòu)的有效證明。其所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)對(duì)二級(jí)分支機(jī)構(gòu)進(jìn)行審核鑒定，督促其及時(shí)預(yù)繳企業(yè)所得稅。

    以總機(jī)構(gòu)名義進(jìn)行生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)的非法人分支機(jī)構(gòu)，無(wú)法提供有效證據(jù)證明其二級(jí)及二級(jí)以下分支機(jī)構(gòu)身份的，應(yīng)視同獨(dú)立納稅人計(jì)算并就地繳納企業(yè)所得稅，不執(zhí)行《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法〉的通知》（國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)）的相關(guān)規(guī)定。

    二、關(guān)于總分支機(jī)構(gòu)適用不同稅率時(shí)企業(yè)所得稅款計(jì)算和繳納問(wèn)題

    預(yù)繳時(shí)，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算全部應(yīng)納稅所得額，然后按照國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，計(jì)算劃分不同稅率地區(qū)機(jī)構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計(jì)算應(yīng)納稅額后加總計(jì)算出企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額。再按照國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，向總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偩偷仡A(yù)繳的企業(yè)所得稅款。

    匯繳時(shí)，企業(yè)年度應(yīng)納所得稅額應(yīng)按上述方法并采用各分支機(jī)構(gòu)匯算清繳所屬年度的三因素計(jì)算確定。

　  除《國(guó)務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過(guò)渡優(yōu)惠政策的通知》（國(guó)發(fā)〔2007〕39號(hào)）、《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財(cái)稅〔2008〕1號(hào)）和《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實(shí)國(guó)務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過(guò)渡優(yōu)惠政策有關(guān)問(wèn)題的通知》（財(cái)稅〔2008〕21號(hào)）有關(guān)規(guī)定外，跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)不得按照上述總分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的計(jì)算方法計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅，應(yīng)按照企業(yè)適用統(tǒng)一的稅率計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。

　　三、關(guān)于預(yù)繳和年度匯算清繳時(shí)分支機(jī)構(gòu)報(bào)送資料問(wèn)題

    跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)在進(jìn)行企業(yè)所得稅預(yù)繳和年度匯算清繳時(shí)，二級(jí)分支機(jī)構(gòu)應(yīng)向其所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送其本級(jí)及以下分支機(jī)構(gòu)的生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)情況，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)對(duì)報(bào)送資料加強(qiáng)審核，并作為對(duì)二級(jí)分支機(jī)構(gòu)計(jì)算分?jǐn)偠惪畋壤娜?xiàng)指標(biāo)和應(yīng)分?jǐn)側(cè)霂?kù)所得稅稅款進(jìn)行查驗(yàn)核對(duì)的依據(jù)。

　　四、關(guān)于應(yīng)執(zhí)行未執(zhí)行或未準(zhǔn)確執(zhí)行國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)文件企業(yè)的處理問(wèn)題

　　對(duì)應(yīng)執(zhí)行國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)文件規(guī)定而未執(zhí)行或未正確執(zhí)行上述文件規(guī)定的跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)，在預(yù)繳企業(yè)所得稅時(shí)造成總機(jī)構(gòu)與分支機(jī)構(gòu)之間同時(shí)存在一方（或幾方）多預(yù)繳另一方（或幾方）少預(yù)繳稅款的，其總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅低于按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的數(shù)額的，應(yīng)在隨后的預(yù)繳期間內(nèi)，由總機(jī)構(gòu)將按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的稅款差額分配到總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)補(bǔ)繳；其總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅高于按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的數(shù)額的，應(yīng)在隨后的預(yù)繳期間內(nèi)，由總機(jī)構(gòu)將按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的稅款差額從總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)的預(yù)繳數(shù)中扣減。

　　五、國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)文件第二條第二款所列企業(yè)不適用該通知規(guī)定。

　　六、該通知自2009年1月1日起執(zhí)行。